Teaduskoolil on 7-liikmeline nõukogu, mille koosseisu ja esimehe kinnitab rektor õppeprorektori ettepanekul kolmeks aastaks.
Nõukogu koosseisu kuuluvad:
- ametikoha järgi õppeprorektor;
- kaks ülikooli akadeemilist töötajat dekaanide ühisel ettepanekul;
- haridus- ja teadusministeeriumi esindaja;
- kolm liiget õppeprorektori ettepanekul.
Nõukogu
- võtab vastu ülikooli arengukavaga kooskõlas oleva teaduskooli arengukava;
- kinnitab teaduskooli tegevuskava, eelarve ja eelarve täitmise aruande;
- kinnitab teaduskooli aastaaruande;
- teeb rektorile teaduskooli põhikirja muutmise ettepanekuid;
- esitab senatile oma seisukoha teaduskooli direktori kandidaatide kohta;
- otsustab muid käesoleva põhikirja või teiste õigusaktidega tema pädevusse antud küsimusi.